相比于其他杀菌方法如加氯法、臭氧法及紫外汞灯杀菌法，深紫外LED杀菌有诸多优势：

高效杀菌性，深紫外LED所发出的UVC段紫外光对细菌、病毒杀灭作用一般在几秒以内，传统水杀菌方法如氯化物以及臭氧等方法，达到深紫外杀菌效率一般需要20分钟至1小时；

广泛杀菌性，由于细菌、病毒抗原体等微生物对紫外光不具有可抗性，因此深紫外光对几乎所有细菌和病毒都能高效率杀灭，并且深紫外 LED 杀菌技术，还能在一定程度上抑制一些较高等的水生生物生长，如藻类、红虫、草履虫等；

安全环保（不含汞），深紫外LED器件相对于目前市场上的汞激发紫外灯最明显优势在于其杀菌光源不含汞，而汞是一种重金属物质，俗称水银，汞在常温下即可蒸发，汞蒸气和汞化合物有剧毒（慢性），传统紫外汞灯杀菌灯在杀菌过程中，一旦灯管破裂，将引起严重的水质污染，而深紫外LED器件是一种安全可靠的装置，不含重金属，操作简单、运行安全可靠；

节能、寿命长、维护成本低，深紫外LED杀菌器正逐渐取代市场上普遍的汞灯紫外杀菌器，重要原因之一是紫外LED功耗较低，十分节能，深紫外LED功率大约是汞灯十分之一，这一比率大大节省了成本；

体积小、设计灵活、安装方便，深紫外LED器件，体积小，其杀菌装置设计灵活，可以应用在传统紫外汞灯无法应用的狭小空间。